Cloning, Bioinformatics and Expression Analysis of <i>SmWRKY53 </i>Gene in <i>Solanum melongena </i>L
نویسندگان
چکیده
In this study, SmWRKY53 gene was selected from the data of high temperture transcriptome and gene expression detection "Tewangda" seedlings. It then cloned, bioinformatics preliminary analyzed. The results showed that open reading frame 1 083 bp, encoding 360 amino acids. 138-144 acids contain a typical "WRKYGQK" conserved domain, zinc finger structure is C 2 HC type, belonging to Group Ⅲ subfamily. homology comparison phylogenetic tree analysis closely related StWRKY53 potato ( Solanum tuberosum ), 91.41%. Bioinformatics prediction basic unstable hydrophilic protein with no signal peptide transmembrane domain. ratio random coil in secondary highest, 63.89%. There acid disorder structural regions protein. Subcellular localization indicated most likely located nucleus. Quantitative Real-time PCR relative levels was highest mature stem lowest flesh. in roots, stems leaves eggplant seedlings first increased decreased, reached peak at 3 h under temperature stress. This study provides reference for further exploring function SmWRKY53 gene.
منابع مشابه
In silico cloning and bioinformatics study of Brucella melitensis Omp31 antigen in different mammalian expression vectors
Brucella melitensis, as a pathogenic gram-negative intracellular bacterium, causes brucellosis in animals and humans. According to literature, the B. melitensis outer membrane protein 31 (Omp31) is considered as an important vaccine candidate against brucellosis. The aim of the current study was to compare three different expression constructs containing B. melitensis Omp31 antigen using bioinf...
متن کاملthe stady and analysis of rice agroclimatology in lenjan
the west of esfahan province, iran, is one of the most important agricultural areas throughout the country due to the climate variability and life-giving water of zayanderood river. rice is one of the major and economic crops in this area. the most important climatic elements in agricultural activities which should be considered include temperature, relative humidity, precipitation and wind. so...
15 صفحه اولthe analysis of the role of the speech acts theory in translating and dubbing hollywood films
از محوری ترین اثراتی که یک فیلم سینمایی ایجاد می کند دیالوگ هایی است که هنرپیش گان فیلم میگویند. به زعم یک فیلم ساز, یک شیوه متأثر نمودن مخاطب از اثر منظوره نیروی گفتارهای گوینده, مثل نیروی عاطفی, ترس آور, غم انگیز, هیجان انگیز و غیره, است. این مطالعه به بررسی این مسأله مبادرت کرده است که آیا نیروی فراگفتاری هنرپیش گان به مثابه ی اعمال گفتاری در پنج فیلم هالیوودی در نسخه های دوبله شده باز تولید...
15 صفحه اولa contrastive analysis of concord and head parameter in english and azerbaijani
این پایان نامه به بررسی و مقایسه دو موضوع مطابقه میان فعل و فاعل (از نظر شخص و مشار) و هسته عبارت در دو زبان انگلیسی و آذربایجانی می پردازد. اول رابطه دستوری مطابقه مورد بررسی قرار می گیرد. مطابقه به این معناست که فعل مفرد به همراه فاعل مفرد و فعل جمع به همراه فاعل جمع می آید. در انگلیسی تمام افعال، بجز فعل بودن (to be) از نظر شمار با فاعلشان فقط در سوم شخص مفرد و در زمان حال مطابقت نشان میدهند...
15 صفحه اولCloning, expression, and spectral analysis of mouse betatrophin
Background: Betatrophin, a novel secretory protein from liver and fatty tissues, is believed to be involved in lipid and glucose metabolism. However, its precise physiological role remains unclear. Here, we report the cloning, expression, and purification steps of mouse betatrophin in a prokaryotic system, followed by its structural analysis. Methods: Specific cloning primers were...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Molecular plant breeding
سال: 2023
ISSN: ['1923-8266']
DOI: https://doi.org/10.5376/mpb.2023.14.0015